Mózg mężczyzny zbudowany jest niemal dokładnie tak, jak mózg kobiety, a ewentualne zmiany w strukturze poszczególnych elementów nie wynika z płci. Choć powszechnie uważa się, że męski i kobiecy mózg znacznie się od siebie różnią, nie jest to do końca prawda.
Ewentualne różnice, które mogą wystąpić, związane są przede wszystkim z budową całego ciała. Osoby niskie lub bardzo drobne będą miały nieco mniejszy mózg niż osoby postawne, których głowa jest nieco większa. Nie wpływa to jednak na pracę samego mózgu - dodatkowo naukowcy uważają, że mniejsze objętościowo mózgi mają bardziej ściśnięte połączenia nerwowe, co może mieć pozytywny wpływ na ich pracę.
Mózg mężczyzny złożony jest z móżdżka, pnia, mózgowia i rdzenia kręgowego, co razem łączy się w ośrodkowy układ nerwowy. W mózgu znajduje się dodatkowo ciało migdałowate, które odpowiada za odczuwanie emocji, a także hipokamp, którego zadaniem jest wspieranie pamięci i koncentracji.
Istnieje przekonanie, że męski mózg pracuje inaczej niż mózg kobiecy, jednak naukowcy dementują ten stereotyp, ponieważ budowa mózgu ani jego struktura nie wpływają znacząco na zachowanie.
Faktem jest, że większość mężczyzn myśli bardziej analitycznie i w podejmowaniu decyzji kierują się logiką. Kobiety natomiast działają bardziej emocjonalnie. Nie wiąże się to jednak z różnicami w budowie czy strukturze mózgu, ale z gospodarki hormonalnej. W organizmie męskim produkuje się więcej testosteronu, co znacznie wpływa na ich zachowanie. Są także dużo bardziej skupieni na wykonywanej przez siebie czynności i trudno im pracować nad wieloma rzeczami jednocześnie. Choć zdarzają się mężczyźni, którzy doskonale radzą sobie z robieniem wielu rzeczy w tym samym czasie, jednak ta domena przypisana jest kobietom. Według naukowców ma to związek z ewolucją.
Mężczyźni dodatkowo mają skłonność do szybszego reagowania i podejmowania decyzji, a także mają zwykle lepszą orientację w terenie i przestrzeni. Jak mówią naukowcy, nie ma to żadnego związku z budową mózgu czy pracą ośrodkowego układu nerwowego, ale ze złożonością całego organizmu i gospodarki hormonalnej.